决战之后，瑞为了修复被元星撕裂的大地而耗尽能量，却在沉睡中被来自宇宙深处的神秘信号唤醒。
在第二季的元星核爆大战后，瑞（纳米核心）为了修复破碎的地球地表，将自身能量几乎耗尽，进入长达五年的沉睡。当他苏醒时，世界格局已变：人类与变种人达成了脆弱的和平，共同开发星际科技。瑞发现自己被当作战神供奉，但他越来越觉得这和平背后隐藏着阴谋。一段来自外太空的重复信号被破译，内容竟是：“关闭核心，否则毁灭。”瑞试图调查信号源，却发现当年并肩作战的伙伴们各怀鬼胎，有人甚至试图提取他体内的纳米核心能量来制造终极武器。本季将揭开纳米核心的真正来源——它并非地球产物，而是一个即将毁灭的高等文明留下的“审判装置”。
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公认的“妻管严”软饭男，在妻子意外失忆后，决定导演一出“我是大佬”的假戏。
三座城市接连出现女性失踪案，一名非科班出身的出租车司机提供的路线图成了破案关键。
一只戴着怀表、会说人话的兔子闯入单亲妈妈的生活，并警告她：她的女儿将在七天后死去。
苏州河上的评弹女伶，用一曲《秦淮景》周旋于三大军阀之间，只为救一城百姓。
六个互不相识的陌生人受邀参加一个秘密派对，醒来后发现自己被锁在一座废弃的精神病院里，而他们中间隐藏着一个连环杀手。
一个单身母亲搬进了号称“最后安全”的智能住宅，却发现房子开始为她“清除”所有威胁。
一所坐落在车站前的奇怪大学，开设所有“没用”的专业，比如“如何优雅地排队”。
一对八字相克的姐妹被迫联手，用祖传的“骂鬼功”驱逐闹事厉鬼。
